El término «Reino Monera» lo introdujo Ernst Haeckel, un ferviente evolucionista, en el año 1986 y se usó durante un tiempo pero hoy en día se encuentra obsoleto, es decir, ya no se usa puesto que existe una clasificación diferente. En el año 1969, Robert. H Whittaker propone una nueva clasificación de los reinos de seres vivos. A día de hoy, y gracias a los grandes avances en biología molecular, las bacterias y cianobacterias se distribuyen en dos dominios separados: Bacteria y Archaea.
Estos dominios engloban una rica diversidad de microorganismos unicelulares, algunos adaptados a entornos extremos. El Reino Monera abarca organismos antiguos y prolíficos, presentes en diversos ecosistemas, ya sean acuáticos o terrestres.
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